Para las pruebas de paternidad, la metodología utilizada se basa en el análisis de un número mínimo (17 STRs) de sistemas polimórficos autosómicos de ADN que se analizan a través de técnicas de PCR, los fragmentos obtenidos tras la PCR se visualizan en secuenciadores automáticos de ADN. Una vez obtenido el resultado se realiza un análisis estadístico de los mismos, con lo que obtendremos una aproximación probabilística de cada caso.